可搭乘台鐵至臺南站，由前站出站直行中山路至湯德章紀念公園(圓環)轉行中正路，過忠義路後遇53巷左轉進入巷弄內，步行約二十分鐘。或轉搭臺南市公車至「中正路站」或「忠義路站」。

本宮奉祀天上聖母威靈赫亦(赫？)，自明清時期檨仔林媽信仰即神蹟遠播。檨仔林位於寧南坊，東以海安街為界，西至莊雅橋街（今永福路二段），北以黃進士街和黃厝祠堂為毗鄰，西南則制福安坑〈今府前路一段〉，而南方及東南隅則以馬兵營為界。古時候防止濱海強風，在檨仔林西南隅種植檨仔林以為防風林。「檨」乃為芒果俗字，而檨仔林地名之由來即係此地大片廣闊的芒果林，故以為名。

檨仔林庄的宗教信仰以永曆十六年秋為起源，當時檨仔林居民多以黃、張二姓為多，宗教信仰則以崇拜祖先靈及樹靈為主。

始於咸豐元年（1850）【誤，應為1851年】，時檨仔林庄民邱朝興於磚仔橋街以其名設立「朝興壇」，咸豐二年〈1850〉【誤，應為1852年】，朝興壇因信眾日趨增加，原址以不敷使用，逐遷移至黃安府邸施囊壯侯祠左側偏堂。咸豐四年〈1854〉冬十一月，朝興壇再遷移至現今公十一停車場、友愛街中段之處。遷徒多次的朝興壇因檨仔林媽祖信仰成熟，由庄民張二爺等庄民募資為朝興壇建立宮廟，並於咸豐八年〈1858〉，宮廟興建竣工，易「朝興壇」之名為「朝興宮」。

同治十二年（1872）夏六月，朝興宮在遷至忠義路公十一停車場入口附近。本以為檨仔林媽祖可以與該只安享萬年香火，奈於光緒廿四年（1898），日人因建立神社，迫遷朝興宮至忠義路公十一停車場入口附近北移至廿公尺處。昭和十年（1935），朝興宮因日人擴張台南神社外苑強與土地徵收，適逢銀同祖廟重修，是故朝興宮逐出資協助整修銀同祖廟，並於昭和十一年（1936）朝興宮將神像正式寄祀於銀同祖廟。昭和二十年〈1945〉 銀同祖廟遭空襲。民國三十五年於現址重建宮廟〈期間朝興宮／保和宮合併而發展出二廟合祀之狀況〉，此地乃第八次遷徒，又民國六十二年朝興宮廟身傾頹，民國六十四年起朝興宮分批擴建為三樓現今樣式。民國九十八年因廟體年久待修，於是動土種【誤，應做「重」】修，民國九十九年三月完工隨即入火安座大典。檨仔林朝興宮自創建屺今一直為寧南坊古地唯一媽祖廟，固守寧南坊古地之黎群，是故甫成知名的「檨仔林媽」亦稱是「寧南媽」。