早年南北高速公路尚未開通，信徒每次從宜蘭、台北到高雄，需花十餘小時方能到達，當年台灣路況欠佳，佛教也沒現在這麼興盛，素食者外出用餐諸多不便，基於不忍讓信徒們受舟車勞頓之苦，大師便慈悲地對弟子們表示：『我們應該在中部地區，找一個能讓信徒們中途休息跟吃飯的地方』。於是在彰化興建了佛光山的第一個分別院『福山寺』。福山寺位於彰化市福山里福山街的山坡地上，背倚秀麗的八卦山，面臨台中大肚溪，與成功嶺遙遙相望，民國六十四年動工，歷經十年，大雄寶殿才正式落成使用，可見當年募款之不易，建寺之艱辛！

雖然是為了方便信徒回佛光山，才籌建了福山寺，但星雲大師秉持佛光山「以教育培養人才、以文化弘揚佛法、以慈善福利社會、以共修淨化人心」的理念，民國六十八年，將中國佛教研究院，自台北遷移至福山寺，慈怡法師繼慈嘉法師之後接任福山寺住持，繼續完成建寺工作，另又主持佛光大藏經及佛光大辭典之編輯。

民國七十二年七月，更在此創立福山佛學院，其所培育出來的畢業生，至今已分發到全球五大洲。

民國七十四年七月大雄寶殿落成後，啟建戒壇，傳授在家五戒、菩薩戒，以落實弘揚佛法之大任。其後所舉辦的報恩法會、光明燈法會、八關齋戒、念佛共修會，皆為成就信眾福慧雙修之道業。慈怡法師所編纂之「佛光大辭典」、「佛教史年表」以及「佛光大藏經」為中國佛教史寫下光輝燦爛的一頁。

民國七十六年間，福山寺因受地層下陷影響，經佛光山開山星雲大師指示，著手規劃此處成為多功能的佛教大樓。

民國八十六年九月二十一日，由當時擔任佛光山宗長之心定和尚，帶領信眾千人，隆重舉行破土重建典禮。近十年的重建經費，全賴中部地區的佛光會會員，與道場法師籌辦各項募款義賣活動；以及信徒、義工們，在福山寺旁邊空地成立資源回收場，每天不畏風吹日曬，全年無休的從事資回收工作，僧俗二眾勞心勞力換取這片修持勝地，因此福山寺又名「環保寺」。

重建後的福山寺有六千多坪，地下二層、地上五層。已成為兼具文化、教育、藝術、人文等多功能的佛教社教大樓。一樓是可容納一千六百多人的大會堂，二樓有舞蹈教室、人間福報辦公室，三樓是法師辦公室、中區協會辦公室，四、五樓是教室。地下二樓設有室內停車場地。地下一樓提供團體專用的素食餐廳。