台灣光復後，地方信徒集議重建寺宇，乃收購寺地，卜興工程，落成後迎回佛像改名圓福寺，另建義士廟於寺前空地右角，至民國四十六年，開正法師晉山接任住持。後因財務問題，於民國六十九年交由佛光山管理，佛光山開山宗長星雲大師即任命依嚴法師前來接引信眾學佛，民國七十年在星雲大師的指導下重新改建，並正式更名為佛光山嘉義圓福寺。
　　二十七年來，圓福寺秉持星雲大師以文教弘揚佛法的理念，在歷任住持依嚴法師、堅寬法師、依導法師、永毓法師、永餘法師、妙凡法師的經營，前任住持依恆法師及現任住持覺禹法師的努力下，目前已從台灣傳統寺廟「巖仔」的形態，成功轉型為佛教現代化道場，除了例行性法會外，定期山區義診、監獄佈教，考生祈福並設有博愛社區大學分校附設兒童學習中心推動各項社教活動，目前已開辦才藝班、佛學班、生活講座、佛學講座，各項講習會、成立人間佛教讀書會、圓福幼童軍團，和嘉義市政府合辦全年度生命教育講座。
　　圓福寺以教育培養人才、以文化弘揚佛法、以慈善福利社會、以共修淨化人心實踐寺院學校化，學校寺院化的功能，承辦大型的法會如：監獄皈依三寶甘露灌頂暨佛學講座、佛光山全省巡迴甘露灌頂皈依三寶典禮禪淨密三修法會，參加人次達萬人以上，提供社會一個心靈的加油站，營造安和樂利的社會。

圓福寺與大樹的因緣
民國六十八年三月的一個午後，陳斗棩老里長若有所思地坐在圓福寺旁一棵近二百年的芒果樹下，不時喃喃自語道：「只剩下五天的期限了，再不繳清積欠的二百萬地稅，圓福寺就得面臨被充公拍賣的命運，到時候我就是斷送這座古剎的罪人，該怎辦？」想著，想著，竟睡著了。睡夢中，聽到有人在他耳邊喊著：「大樹！大樹！」驚醒後，想到一定是菩薩的指示，到處問人「大樹」的含意，有一位居士說「高雄有個大樹鄉，聽說那裡有個佛光山，住持星雲大師是一位慈悲的得道高僧，是不是菩薩指點我們去找星雲大師？」

當時佛光山正值開山期，經濟也非常拮拘，但是向來不願給人失望的星雲大師，仍然允諾解決圓福寺的困難。圓福寺於民國六十九年交由佛光山管理後，即任命依嚴法師為住持，民國七十年大師的指導下重新改建，並更名為「佛光山圓福寺」。

二十多年來，圓福寺秉持星雲大師以文教弘揚佛法的理念，在多任住持努力下，成功轉型為佛教現代化道場，除了例行性法會外，辦理各項文教、社教活動。定期山區義診、監獄佈教，考生祈福並設有博愛社區大學分校附設兒童學習中心推動各項社教活動。提供社會一個心靈的加油站，營造安和樂利的社會